Cơ sở sản xuất kinh doanh trong quá trình hoạt động có thể phải đi thuê tài sản (máy móc thiết bị, phương tiện…). Nghĩa vụ của bên thuê tài sản được quy định tại Điều 479 Bộ luật Dân sự số 91/2015/QH13:
“Điều 479. Nghĩa vụ bảo quản tài sản thuê.
1. Bên thuê phải bảo quản tài sản thuê, phải bảo dưỡng và sửa chữa nhỏ; nếu làm mất, hư hỏng thì phải bồi thường.
Bên thuê không chịu trách nhiệm về những hao mòn tự nhiên do sử dụng tài sản thuê.
2. Bên thuê có thể tu sửa và làm tăng giá trị tài sản thuê, nếu được bên cho thuê đồng ý và có quyền yêu cầu bên cho thuê thanh toán chi phí hợp lý”.
Tại khoản 1 Điều 5 Thông tư số 219/2013/TT-BTC ngày 31/12/203 của Bộ Tài chính quy định:
“Điều 5. Các trường hợp không phải kê khai, tính nộp thuế GTGT
1. Tổ chức, cá nhân nhận các khoản thu về bồi thường bằng tiền (bao gồm cả tiền bồi thường về đất và tài sản trên đất khi bị thu hồi đất theo quyết định của cơ quan nhà nước có thẩm quyền), tiền thưởng, tiền hỗ trợ, tiền chuyển nhượng quyền phát thải và các khoản thu tài chính khác.
Cơ sở kinh doanh khi nhận khoản tiền thu về bồi thường, tiền thưởng, tiền hỗ trợ nhận được, tiền chuyển nhượng quyền phát thải và các khoản thu tài chính khác thì lập chứng từ thu theo quy định. Đối với cơ sở kinh doanh chi tiền, căn cứ mục đích chi để lập chứng từ chi tiền.
Trường hợp bồi thường bằng hàng hoá, dịch vụ, cơ sở bồi thường phải lập hoá đơn và kê khai, tính, nộp thuế GTGT như đối với bán hàng hoá, dịch vụ; cơ sở nhận bồi thường kê khai, khấu trừ theo quy định”.
Như vậy, trường hợp trong thời gian bảo quản tài sản thuê, bên thuê đã làm mất tài sản, theo quy định tại Điều 479 Bộ luật Dân sự số 91/2015/QH13 nêu trên bên thuê phải bồi thường thiệt hại cho bên cho thuê, việc bồi thường có thể bằng tiền hoặc hàng hóa, dịch vụ.
Trường hợp bồi thường bằng tiền thì bên nhận bồi thường không phải kê khai, tính nộp thuế GTGT theo quy định.
Trường hợp bồi thường bằng hàng hóa, dịch vụ thì bên thuê (bên bồi thường) phải lập hoá đơn và kê khai, tính, nộp thuế GTGT như đối với bán hàng hoá, dịch vụ, đồng thời bên cho thuê (bên nhận bồi thường) kê khai, khấu trừ thuế GTGT theo quy định.
