Đồn được giao nhiệm vụ quản lý, bảo vệ biên giới vùng biển có chính diện vạch phân định Vịnh Bắc Bộ 2 nước Việt Nam – Trung Quốc dài 20km; chiều sâu địa giới hành chính thị trấn Cô Tô và xã Đồng Tiến, huyện Cô Tô. Địa bàn quản lý rộng, nhiều đảo, luồng lạch phức tạp; khí hậu thời tiết khắc nghiệt, đời sống nhân dân còn gặp nhiều khó khăn, nên nhiệm vụ bảo vệ chủ quyền, an ninh biên giới gắn với đấu tranh phòng chống BLGLTM của đơn vị gặp không ít khó khăn.
Xác định rõ đặc điểm, tình hình của địa phương, đơn vị, Đồn đã triển khai đồng bộ các biện pháp đấu tranh trấn áp tội phạm BLGLTM và hàng giả ở khu vực biên giới, vùng biển đảo đơn vị phụ trách quản lý. Hằng năm Đảng ủy, Ban Chỉ huy Đồn sớm tổ chức quán triệt cho CBCS đơn vị thực hiện nghiêm các nghị quyết, chỉ thị của trung ương, của tỉnh về đấu tranh chống BLGLTM. Đơn vị chủ động làm tốt công tác nắm, đánh giá tình hình nội, ngoại biên, tình hình trên tuyến biên giới biển, đảo để tham mưu cho cấp trên chỉ đạo xây dựng kế hoạch bảo vệ vùng biển, đảo sát với tình hình địa bàn.
Từ đầu năm 2024 đến nay đơn vị tổ chức 72 lượt tổ/72 lượt phương tiện/432 CBCS tuần tra kiểm soát, bảo vệ vững chắc chủ quyền an ninh vùng biển đảo đơn vị phụ trách; thực hiện đăng ký, kiểm soát chặt chẽ 1.890 lượt tàu khách/192.924 lượt khách tham quan du lịch ra vào khu vực đảo Cô Tô, trong đó có hàng trăm lượt khách du lịch nước ngoài.
CBCS đơn vị luôn gắn bó máu thịt với nhân dân, phát huy sức mạnh tổng hợp của quần chúng nhân dân trong bảo vệ chủ quyền, an ninh biển đảo. Từ đầu năm 2024 đến nay, Đồn đã cử hàng trăm lượt CBCS trực tiếp xuống địa bàn tham gia cùng cán bộ, nhân dân địa phương xây dựng NTM; hỗ trợ các hộ phát triển kinh tế; giúp các khu dân cư dọn vệ sinh, bảo vệ môi trường biển.
Quá trình tham gia giúp dân, CBCS của đơn vị lồng ghép tuyên truyền, vận động nhân dân chấp hành nghiêm các chủ trương, đường lối của Đảng, chính sách, pháp luật của Nhà nước, quy định của địa phương. Trong đó, Đồn đặc biệt chú trọng tuyên truyền Luật Biên phòng Việt Nam, tuyên truyền về biển, đảo và bảo vệ chủ quyền biển, đảo; thực hiện chính sách pháp luật về quản lý nuôi, chế biến thủy sản và chống khai thác thủy sản bất hợp pháp, không báo cáo và không theo quy định (IUU)…
Nhờ đó người dân ngày càng ý thức rõ hơn trách nhiệm của mình trong tham gia quản lý, bảo vệ chủ quyền vùng biển, đảo; tích cực tham gia cùng lực lượng BĐBP bảo vệ chủ quyền, đấu tranh ngăn chặn hiệu quả các hoạt động buôn lậu, vi phạm pháp luật trên biển, đảo.
Với các giải pháp quyết liệt, phù hợp, 6 tháng đầu năm 2024, Đồn Biên phòng Cô Tô đã bắt giữ, xử lý 11 vụ/11 phương tiện/11 đối tượng vi phạm pháp luật trên biên giới, vùng biển đảo đơn vị quản lý; xử phạt vi phạm hành chính 68,7 triệu đồng.