Publication d'une nouvelle étude sur l'origine du Covid-19 à partir de données chinoises

L'étude ci-dessus sur l'origine du Covid-19 est basée sur une nouvelle analyse des données publiées par le Centre chinois de contrôle et de prévention des maladies (China CDC), selon le site Web News Medical (Royaume-Uni) le 20 septembre.

Les données concernaient plus de 800 échantillons collectés à partir du 1er janvier 2020 dans et autour du marché de fruits de mer de Huanan dans la ville de Wuhan, province du Hubei, en Chine, et à partir de génomes viraux signalés chez des patients atteints de Covid-19 aux premiers stades de la pandémie. La nouvelle étude a été publiée dans la revue Cell le 19 septembre.

Image agrandie de cellules infectées par le virus Covid-19 SARS-CoV-2 (jaune)

« Il s'agit de l'un des ensembles de données les plus importants sur les origines de la pandémie de Covid-19 encore existant. Nous sommes extrêmement reconnaissants que ces données existent et soient partagées », a déclaré Florence Débarre, co-auteure de l'étude et directrice du Centre national de la recherche scientifique (CNRS).

De plus, le co-auteur Michael Worobey de l'Université d'Arizona (États-Unis) a déclaré que les chercheurs ont analysé des données extrêmement importantes collectées par le CDC chinois de nouvelles manières. « Il s’agit d’une analyse éclairée de ces données et elle montre qu’elles correspondent au reste de l’énorme corpus de preuves dont nous disposons sur la façon dont la pandémie a commencé », a souligné Worobey.

Comment le CDC chinois a prélevé des échantillons

Le 1er janvier 2020, après le retrait des animaux et quelques heures seulement après la fermeture du marché de Huanan, des enquêteurs du CDC chinois se sont rendus sur le marché pour collecter des échantillons. Ils nettoient les sols, les murs et autres surfaces des stalles. Quelques jours plus tard, ils se sont à nouveau concentrés sur les surfaces des stalles d’animaux sauvages, comme les cages et les chariots utilisés pour déplacer les animaux, et ont collecté des échantillons dans les égouts.

Ils ont séquencé les échantillons à l’aide de la métatranscriptomique, une technique qui capture toutes les séquences d’ARN (et peut également récupérer l’ADN) de tous les organismes de l’échantillon, y compris les virus, les bactéries, les plantes et les animaux.

L'équipe du CDC chinois a publié ses données et résultats de séquençage en 2023 dans la revue Nature . Cependant, cet article n’aborde pas l’identité exacte des animaux trouvés dans les données qui pourraient représenter des hôtes intermédiaires. Le CDC chinois a partagé ses données de séquençage sur des référentiels ouverts.

Selon la dernière analyse des données ci-dessus publiée dans la revue Cell , le virus responsable du Covid-19 SARS-CoV-2 était présent dans plusieurs étals du marché de Huanan, notamment des chiens viverrins et des civettes. Dans certains cas, du matériel génétique du SARS-CoV-2 et de ces animaux a même été retrouvé dans les mêmes échantillons collectés. Les espèces animales exactes ont été identifiées en examinant leurs génomes mitochondriaux dans les échantillons.

On pense que les chiens viverrins sont sensibles au SRAS-CoV-2 et ont été porteurs du SRAS-CoV.

Photo : Capture d'écran du Guardian

« Beaucoup de ces animaux ont été abattus avant l'arrivée de l'équipe du CDC chinois ; nous ne pouvons donc pas avoir de preuve directe de leur infection. Nous étudions les traces d'ADN et d'ARN de ces animaux dans les échantillons et dans certains élevages où le SARS-CoV-2 a été détecté », a déclaré le co-auteur Débarre.

« Ce sont les mêmes animaux qui, comme nous le savons, ont facilité la transmission du coronavirus initial du SRAS aux humains en 2002. C'est la chose la plus dangereuse que les humains aient jamais faite : capturer des animaux sauvages chargés de virus, puis jouer avec le feu en les exposant à des humains vivant au cœur des grandes villes, où la forte densité de population facilite l'implantation de ces virus », a souligné Worobey.

Pourquoi nous devons trouver l’origine du Covid-19

L’équipe internationale a également effectué une analyse évolutive des premiers génomes viraux signalés lors de la pandémie de Covid-19 et a déduit le génotype ancestral le plus probable du virus qui a infecté les humains et conduit à la pandémie de Covid-19. Les résultats ont montré qu'il y avait très peu de personnes infectées avant l'épidémie sur le marché des fruits de mer de Huanan. Ce résultat est cohérent avec la propagation du Covid-19 des animaux aux humains sur ce marché, selon la revue Cell.

De nouvelles recherches fournissent une courte liste d'animaux présents sur le marché aux fruits de mer de Huanan, trouvés en coexistence ou à proximité d'échantillons de virus qui pourraient représenter les hôtes intermédiaires les plus probables du SRAS-CoV-2. Parmi eux, les chiens viverrins, une espèce sensible au SRAS-CoV-2 et anciennement porteur du SRAS-CoV, se sont révélés être l'animal possédant le plus de matériel génétique dans les échantillons prélevés dans les étals d'animaux sauvages du marché de Huanan. Du matériel génétique provenant de civettes, qui ont également été liées à l'épidémie de SRAS-CoV de 2023, a également été trouvé dans un échantillon contenant de l'ARN du SRAS-CoV-2. D’autres espèces telles que le rat géant du bambou et le porc-épic malais ont également été trouvées présentes dans des échantillons positifs au SRAS-CoV-2.

Bien que les données ne puissent pas prouver si un ou plusieurs des animaux ci-dessus ont pu être infectés par le SRAS-CoV-2, l'analyse de l'équipe fournit une liste claire des espèces susceptibles d'être porteuses du SRAS-CoV-2 et les informations génétiques qui peuvent être utilisées pour aider à retracer leurs origines.

Les chercheurs soulignent l’importance de comprendre les origines de la pandémie de Covid-19. « De nombreuses informations erronées circulent sur les origines du SARS-CoV-2. S'il est important de les identifier, c'est parce qu'elles ont un impact sur la sécurité nationale et la santé publique, non seulement aux États-Unis, mais dans le monde entier. Et en réalité, malgré l'attention accrue portée à la sécurité des laboratoires depuis le début de la pandémie il y a plus de quatre ans, peu de mesures ont été prises pour réduire le risque de réapparition d'une zoonose comme celle-ci », a averti Worobey.

Source : https://thanhnien.vn/cong-bo-nghien-cuu-moi-ve-nguon-goc-covid-19-tu-du-lieu-cua-trung-quoc-185240921093431147.htm